A coleção de aves do Museu de História Natural conta com cerca de 650 espécimes, considerando amostras de animais taxidermizados, esqueletos, amostras de tecido (preservados em etanol ou congeladas), carcaças e espécimes inteiros preservados em via úmida (etanol ou formalina).
Existem aves dos mais diferentes tamanhos, desde enormes albatrozes, como o Albatroz-de-sobrancelha (com envergadura de mais de dois metros), até diminutos beija-flores, como o Rabo-branco-rubro (que pesa cerca de duas gramas). São contempladas, ainda, em menor quantidade, amostras de ninho e ovos.
O acervo ornitológico vem sendo mantido e ampliado pela equipe do Laboratório de Morfologia, Sistemática e Ecologia de Aves (LSEA), que funciona nas dependências do MHN.
A coleção atua também como instituição depositária de amostras coletadas por pesquisadores externos ao museu, que escolhem vincular ao MHN suas autorizações de coleta de fauna emitidas pelos órgãos ambientais competentes (IBAMA ou ICMBio/MMA).
